太岁DNA提取方法差异及对测知细菌结构的影响

以太岁取样的加水热溶解为特点设计4种提取方法,将提取效果好的2个DNA样品用Illumina MiSeq高通量测序平台测序.结果 表明:滤膜法(SI3)和研磨法均可获得显示电泳条带的DNA,但前者能将太岁材料彻底破碎和滤除多糖;滤膜法样品测得优质序列46676条,聚类OTU 1095个,比研磨法多154个,只包含1个序列相对丰度大于1％的共有OTU,特有1个序列相对丰度41.14％的OTU,是研磨法的237倍,但滤膜法样品香农指数反比研磨法低1.37％,并导致两者菌群结构在各分类水平上有着明显差别.太岁DNA提取方法深刻影响细菌结构测定结果,滤膜法DNA菌群信息更真实,据其测知的优势结构为假单胞菌属(Pseudomonas)和不动杆菌属(Acinetobacter).