黄瓜抗寒基因CsRAV2的克隆与序列分析

中国黄瓜品种繁多,很早就开始选育黄瓜品种,但黄瓜的抗逆性不强,容易产生病虫害和冷害.黄瓜幼苗早春定植在露地或冬春季节在保护地栽培,经常会出现低温冷害的情况,这对黄瓜的早熟和高产会有较大影响.因此,分析和验证冷胁迫相关的基因,探究黄瓜抗低温冷害形成的机理,可以为黄瓜耐低温品种的选育和抗性品种的培育奠定基础.本研究中以吉林地区主要栽培品种'翠秋20'为试验材料,通过RNA-seq测序技术筛选出一个AP2/EREBP转录因子中RAV亚族的CsRAV2,推测该基因可能参与黄瓜幼苗冷胁迫,采用PCR技术克隆CsRAV2的序列全长,同时通过生物信息学分析比对,了解CsRAV2的结构域与分类,结果表明:CsRAV2编码区序列全长1122 bp,编码了344 aa,为疏水性蛋白质,无明显信号肽和无跨膜结构,亚细胞定位在细胞核.该研究结果为深入探究CsRAV2基因的功能提供了科学依据.