梯棱羊肚菌MT1全基因组测序及分析
Journal of Fungal Research（2021）
Abstract
梯棱羊肚菌MT1是在辽宁省大面积栽培的菌株.目前我国羊肚菌的种植区主要分布在川渝地区,能够在东北地区大面积种植的菌株极少,限制了东北地区羊肚菌产业的发展,因此需要对能够在东北地区大量栽培种植的羊肚菌菌株的基因信息进行全面了解.通过PacBio Sequel测序平台的CLR测序方式对羊肚菌菌株MT1进行全基因组测序,并对测序结果进行基因组组装、基因预测与功能注释.结果 表明:MT1基因组大小约为82.29 Mb,测序深度达到282x,N50达到1.028 Mb,GC含量为53.24％.在GO、KEGG、KOG、Swiss-Prot、Nr、CAZy数据库分别注释到9144、8810、2844、3642、9818、529个基因.从基因组层面上解析MT1菌株,为更好地筛选出适宜在东北地区栽培的优良羊肚菌菌株提供参考信息.
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