动脉粥样硬化组织的差异基因表达及免疫细胞浸润

目的 利用生物信息学方法分析动脉粥样硬化(AS)组织的差异基因表达及免疫细胞浸润情况.方法 下载GEO数据库中高通量基因芯片数据集GSE100927,进行差异基因表达分析,并进行GO基因功能注释和通路分析,然后进行蛋白相互作用网络分析及可视化展示,同时对AS组织的免疫细胞浸润情况进行分析.结果 通过对芯片数据分析,将差异基因进行生物学富集,最终CCR5、TYROBP、ITGB2、SPI1、ITGAX、CCR1、CCL4、MMP9、CCL3、CSF1R等10个基因被鉴定为hub基因.免疫细胞浸润分析显示,AS组织中记忆B细胞、γδT细胞、巨噬细胞M0、巨噬细胞M1、静息的肥大细胞、激活的肥大细胞丰度显著升高(P＜0.05).结论 通过生物信息学方法可以发现AS组织中差异基因及相关生物学功能以及免疫细胞浸润情况,为AS的基础研究提供支持.