基于网络药理学和分子对接探讨益气活血方抗脑缺血机制研究

Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences(2022)

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Abstract
脑缺血(cerebral ischemia,CI)具有高发病率、高致畸率,是全球第二大致死疾病.中药(traditional Chinese medicine,TCM)益气活血方(YQHX)在临床治疗CI发挥一定疗效,但其机制尚不清楚.本文基于网络药理学和分子对接探讨其作用机制.通过TCMSP和CNKI数据库获取益气活血方活性成分;利用Pharmmapper数据库获得成分靶点信息;检索OMIM、GeneCards、DisGeNET数据库得到脑缺血的疾病靶点;Venn图得到交集靶点,Cytoscape可视化结果,插件MCODE获得核心靶点;使用Metascape数据库对核心靶点进行GO和KEGG通路富集分析;选取前20条KEGG通路富集通路用Cytoscape构建"成分-靶点-通路"图;排名前10的成分与前5的靶点信息,利用AutoDock Vina软件进行分子对接验证,用PyMoL、Ligplus软件可视化结果.筛选得到益气活血方活性成分83个,相应靶点432个,疾病相关靶点2005个,药物与疾病的交集靶点140个;通过GO生物功能分析和KEGG通路富集分析得到507条生物功能条目及141条信号通路.KEGG通路富集分析主要参与细胞增殖、粘附、迁移等过程;分子对接结果显示,筛选的关键成分与核心靶点皆具备较强的结合活性,其中EGFR、MAP2Kl、KDR与丹参新酮Ⅰ、丹参酮二酚结合较为稳定.益气活血方治疗脑缺血主要生物学机制可能通过酪氨酸激酶受体相关的信号通路发挥作用,也是对中医"益气活血,血脉新生"理论的完善.
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Key words
Network pharmacology,Molecular docking,YQHX,Cerebral ischemia,Mechanism
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