POLE2在肺腺癌组织中表达及其生物信息学分析

Acta Aacademiae Medicinae Qingdao Universitatis(2022)

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摘要
目的 利用肿瘤相关数据库探讨DNA聚合酶εB亚基(POLE2)基因在肺腺癌中的表达及其对生存预后的影响.方法 使用GEPIA数据库和Oncomine数据库分析不同肺腺癌数据集中POLE2 mRNA的表达情况,利用Kaplan-Meier Plotter进行POLE2表达水平与肺腺癌病人总生存期的相关性分析.利用cBioPortal数据库和LinkedOmics数据库分析肺腺癌组织中的POLE2表达相关基因.利用Enrichr数据库和STRING数据库对POLE2表达相关基因进行富集分析,利用TIMER数据库了解POLE2与免疫细胞的关系.结果 与正常肺组织比较,肺腺癌组织中POLE2 mRNA水平呈高表达(|log2 FC|=0.5,P<0.01).高表达POLE2的肺腺癌病人总生存期更短(χ2=9.134,P<0.01).与POLE2表达相关基因共37个.GO分析显示,POLE2表达相关基因主要富集在DNA聚合酶的激活、DNA的复制、DNA的修复等生物学过程.KEGG通路分析显示,POLE2表达相关基因主要参与了碱基切除修复、DNA复制、核苷酸切除修复等信号通路.蛋白相互作用分析显示,PRIM2、POLA1、POLA2、CDC45等基因与POLE2有潜在的或密切的相互作用.POLE2基因在肺腺癌免疫微环境中与B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞均无明显相关性.结论 POLE2在肺腺癌组织中呈高表达,且其表达水平与肿瘤预后具有相关性,POLE2在肺腺癌中的高表达预示病人预后不良.
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