基于网络药理学的鬼针草治疗干眼的机制研究
Chinese Journal of Chinese Ophthalmology(2022)
Abstract
目的 基于网络药理学方法探究鬼针草治疗干眼的作用靶点及机制.方法 通过TCMSP数据库收集鬼针草的化学成分,筛选出活性成分,并使用Uniprot进行基因名称转化;运用OMIM、DrugBank、TTD、Genecards数据库获得干眼相关靶基因,通过Venny图获得"鬼针草-干眼"共有靶点作为关键基因,随后对关键基因开展蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)构建,依据Degree算法获取核心基因;再进行基因本体学(GO)和Kyoto基因与基因组百科全书(KEGG)分析,并依据GO富集结果,使用Cytoscape软件构建"鬼针草-干眼-通路"网络图.结果 鬼针草筛选出6个活性化合物,218个靶点;干眼筛选出1,313条靶基因,取交集后得到123个交集基因.对关键基因开展PPI网络构建得到排名前10的核心基因为:AKT1、IL-6、TP53、VEGFA、TNF、JUN、CASP3、EGF、EGFR、PTGS2.GO富集结果共870条,主要与调控细胞炎症因子、细胞凋亡、免疫反应、衰老等有关;KEGG结果共241条,主要与TLR信号通路,NF-κB信号通路、MAPK信号通路等有关.结论 鬼针草可能是通过对EGF、TNF、VEGFA、IL-6等基因的影响,以及对TLR信号通路、NF-κB信号通路、MARK信号通路的调控,达到减轻干眼患者眼表炎症反应的效果,改善干眼主观症状及临床指标.本研究可为干眼的药物选择及特异性治疗方案提供新思路.
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