陆地棉GhCRE1基因的生物信息学分析
Agricultural Science & Technology（2021）
Abstract
细胞分裂素在植物的生长发育中起着非常重要的作用,CRE1已被鉴定为细胞分裂素受体,然而CRE1在棉花中的生物学功能尚不清楚.本文通过克隆GhCRE1基因,并对其序列进行生物信息学分析,发现GhCRE1基因有11个外显子和10个内含子;与可可和拟南芥两种植物同源基因相比,其分子量、pI和氨基酸数均不同,具有3个不同的蛋白结构域.通过多种生物信息学网站预测发现了15个与CRE1蛋白存在潜在相互作用的未鉴定蛋白和CRE1蛋白序列上的2个磷酸化位点.此外在CRE1启动子序列上发现了8个与光信号和激素相关的顺式作用元件.这些结果将有助于揭示该基因在陆地棉中的功能.
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Key words
Bioinformatics analysis,Cytokinin receptor,Gene,Protein,Promoter
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