基于网络药理学和分子对接分析豆根管食通口服液治疗食管癌的分子机制
China Journal of Chinese Medicine(2022)
Abstract
目的:通过网络药理学和分子对接技术分析豆根管食通口服液治疗食管癌的分子机制.方法:检索多个数据库并筛选豆根管食通口服液有效活性成分和其作用于食管癌(esophageal carcinoma,EC)的相关靶点,并采用Cytoscape软件分别构建"药物-活性成分-靶点""靶点-通路"网络图;采用CytoHubba插件中多种算法筛选豆根管食通口服液治疗EC关键靶点,并采用R软件对关键靶点进行基因本体(gene discovery,GO)生物功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopodia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析;采用分子对接技术对有效活性化合物和靶蛋白的结合能力进行验证.结果:从豆根管食通口服液方中药中共筛选出59种活性成分,治疗EC靶点106个,其中关键靶点21个.KEGG信号通路富集分析发现,关键靶点主要富集在白细胞介素-17(interleukin 17,IL-17)信号通路、缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路等107个通路;GO生物功能富集分析发现,关键靶点主要涉及DNA结合转录因子活性的调节、细胞对氧化应激的反应等1341个生物过程,丝裂原活化蛋白激酶(mitogen activated protein kinases,MAPK)活性、生长因子活性等59个分子功能,细胞定位在囊泡腔、膜区等26个细胞组分.分子对接提示药物活性成分β-谷甾醇、山柰酚、槲皮素与表皮生长因子受体和MAPK3靶点对接良好.结论:豆根管食通口服液治疗EC具有多成分、多途径、多靶点的优势.
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