宏基因组二代测序在间质性肺病伴感染患者中的应用

目的:探讨宏基因组二代测序(mNGS)在间质性肺病(ILD)伴肺部感染患者中的初步应用。方法:本研究为病例对照研究。采用单纯随机抽样法，选取2018年1月至2019年8月南京大学医学院附属鼓楼医院呼吸与危重症医学科住院、诊断为ILD伴感染患者61例为研究对象。按照是否进行mNGS检测，分为mNGS组( n＝18)和对照组( n＝43)。收集研究对象的临床、实验室及胸部影像学资料，并进行电话随访。比较2组患者的临床资料，比较mNGS检测与传统病原微生物培养的差异。采用Kaplan-Meier法及Cox回归模型分析患者生存情况及预后因素。 结果:2组患者比较，除了mNGS组住院时间较对照组明显延长( P＝0.001)，其他临床变量间差异均无统计学意义( P值均>0.05)。mNGS组检测结果与临床综合判断结果符合率为83.3%，传统实验室培养结果与临床综合判断结果符合率为33.3%，差异有统计学意义( P＝0.008)。有50.0%(9/18)的患者根据mNGS检测结果调整治疗方案，44.4%(8/18)的患者经调整治疗后病情好转。Kaplan-Meier生存分析显示mNGS组患者总生存时间较对照组显著延长，差异有统计学意义( P＝0.031)，其中mNGS组患者30 d、180 d、360 d生存率明显高于对照组( P值均<0.05)。单因素Cox回归分析发现外周血白细胞计数、C反应蛋白、降钙素原、血清白蛋白、乳酸脱氢酶、氧合指数、丙种球蛋白使用、mNGS检测均与ILD伴感染患者生存时间有关( P值均<0.05)；多因素Cox回归分析显示血清乳酸脱氢酶水平( HR＝1.01，95% CI：1.00~1.01， P＝0.001)和mNGS检测( HR＝0.12，95% CI：0.02~0.98， P＝0.048)是ILD伴感染患者生存的独立预测因素。 结论:mNGS检测可以及时准确地明确ILD伴感染患者致病原，指导临床医师合理进行抗感染治疗，从而提高患者的生存率，改善患者预后。