广东地区耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药性及分子流行病学特征

目的 分析广东地区耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药形势及分子流行病学特征.方法 对广东地区2019年收集分离的41株CRKP开展抗菌药物敏感性试验鉴定耐药表型,通过全基因组测序分析确定多位点序列分型(MLST)、耐药基因及毒力因子等分子特征,基于全基因组单核苷酸多态性(wgSNPs)分析菌株同源性及遗传进化关系.结果 41株CRKP均为泛耐药菌.耐药基因及可移动遗传元件(MGEs)种类多样,75.61％(31/41)菌株携带碳青霉烯酶基因,包括blaKPC-2(18株)、blaNDM-1(10株)、blaNDM-5(2株)和blaIMP-4(1株)四种类型.其中儿童CRKP主要携带blaNDM-1,而成人则为blaKPC-2.blaNDM-1和blaKPC-2分别主要通过质粒IncX3和IncFII传播.MLST分型共获得16种ST型,以ST11型(51.22％,21/41)为主,且均为非毒力株,而ST65型株则为高毒力特征.系统发育关系表明本地区CRKP流行菌群与全球广泛传播的CRKP具有密切的亲缘关系.结论 广东地区CRKP的耐药形势严峻,产KPC-2型碳青霉烯酶是碳青霉烯类抗菌药物产生耐药性的主要机制.菌株的分子分型多态性较大,存在优势克隆ST11型CRKP在医院及医院间广泛流行和传播.并且由于存在多种MGEs分布,需密切关注获得性高毒力高耐药CRKP的出现,加强耐药基因监测,以识别潜在感染播散风险,提高临床预后.