3对不同抑郁表型青少年同卵双生子的差异甲基化研究

目的 对同卵不同抑郁表型双生子外周血DNA甲基化差异进行筛查,探讨差异基因是否可作为参与抑郁发生的候选基因.方法 募集在校青少年双生子并进行卵形鉴定.以贝克抑郁量表第2版(Beck Depression Inventory-Ⅱ,BDI-Ⅱ)、长处与困难问卷(Strengths and Difficulties Questionnaire,SDQ)学生版本的情绪因子得分确定双生子个体间的抑郁表型差异.850k甲基化测序后选取P＜0.05、且甲基化β值差值绝对值大于0.1(| Aβ| ＞0.1)为差异甲基化位点.进行基因本体论(GO)功能注释分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,以及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,以识别与抑郁症(major depressive disorder,MDD)相关的重要基因及其甲基化水平改变.结果 纳入同卵不同抑郁表型青少年双生子3对,分为抑郁表型组和正常表型组,两组间共筛选出57个有甲基化水平差异基因,其中45个基因DNA甲基化水平升高,12个基因DNA甲基化水平降低.GO分析显示差异基因在中枢神经系统发育、RNA代谢过程调控等生物学过程富集显著,KEGG分析发现其在突触长时程抑制(LTD)、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路有明显富集.而在PPI网络中发现RHOA与多个差异甲基化基因存在直接或间接相互作用.结论 在同卵不同抑郁表型双生子外周血中存在CSF1R、NOS1、AHR等基因的DNA甲基化水平改变,可能调节基因表达并通过LTD、PI3K-Akt等信号通路参与抑郁发生.