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基于CRISPR序列的肠道沙门氏菌分离株CSST分型

CHINA ANIMAL HEALTH INSPECTION(2022)

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Abstract
为验证一种新的CRISPR分型方法——CSST分型方法分型沙门氏菌的可行性,分别采用传统CRISPR与CSST两种分型方法,对20株临床肠道沙门氏菌分离株进行分型.结果显示:CSST分型方法同传统CRISPR分型方法分型沙门氏菌的结果完全一致,均将20株临床肠道沙门氏菌菌株分成了15种亚型,其中CR4/CT4和CR9/CT9为最优势CR/CT型,而其他CR/CT型均呈零星分布.结果表明,CSST分型方法可用于肠道沙门氏菌分型,且比传统CRISPR分型方法更简洁、方便.本研究为沙门氏菌的流行病学溯源提供了重要技术方法.
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