基于EST-SSR标记的青榨槭天然种群遗传多样性分析
Journal of Plant Resources and Environment(2022)
Abstract
采用28对EST-SSR引物对北京、河南、陕西、广东和浙江的青榨槭(Acer davidii Franch.)8个天然种群231株样株的基因组DNA进行扩增,在此基础上对供试种群的遗传多样性和遗传结构进行分析.结果表明:8个天然种群的观测等位基因数和有效等位基因数较为接近,均值分别为3.2和1.6;Shannon's多样性指数、观测杂合度、期望杂合度、Nei's基因多样性指数和多态性信息含量均值分别为0.5127、0.2379、0.2769、0.2719和0.2436.总体来看,8个天然种群中,广东南岭国家森林公园(P7)种群的遗传多样性最高,河南嵩山地质公园(P5)种群的遗传多样性最低,且8个天然种群的观测杂合度小于期望杂合度.8个天然种群间的遗传分化系数为0.3345,基因流为0.5088,种群内和种群间的遗传变异贡献率分别为66.55%和33.45%.供试种群中,P7种群和浙江西天目山森林公园(P8)种群与其余6个种群间的遗传相似系数相对较小,而遗传距离却相对较大.Mantel检验结果显示:青榨槭种群间的遗传距离和地理距离存在极显著正相关(R2=0.5686,P=0.002).UPGMA聚类分析和STRUCTURE分析结果均表明:供试青榨槭8个天然种群被分成2个集群,其中,P7种群和P8种群为一个集群,其余6个种群为另一个集群.综合上述研究结果:青榨槭天然种群的遗传多样性水平较高,其遗传分化主要存在于种群内,种群间的基因交流较少.供试种群内均存在一定程度的自交或近交现象,种群容易衰退,故应加强对青榨槭天然种群的保护力度.
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