'德钦'紫花苜蓿叶绿体基因组序列及特征分析

'德钦'紫花苜蓿(Medicago sativa L.'Deqin',以下简称'德钦'苜蓿)是一种优良的地方品种,具有特异耐旱性、耐热性和耐酸铝性.本研究利用Illumina第二代高通量测序技术对其叶绿体全基因组进行测序(NCBI登录号:MN218692),并对其结构及特征进行分析.结果显示:'德钦'苜蓿叶绿体基因组含有一个反向重复区,属于IR缺失型;总长为125 470 bp,共有110个基因,其中蛋白质编码基因76个、tRNA 30个和rRNA 4个,缺失3个基因(rpsl6,rpl22和infA),总GC含量为33.9％;相对同义密码子使用度显示,'德钦'苜蓿70.74％的密码子使用度＞1,偏好以A和T结尾;共鉴定出115个SSRs位点,其中clpP基因鉴定出与紫花苜蓿不同SSRs位点;最大似然树结果显示'德钦'苜蓿与紫花苜蓿聚在一起,支持率为75％.研究结果将对苜蓿属叶绿体基因组工程研究及'德钦'苜蓿特异基因的进一步鉴定利用提供一定的参考价值.