小鼠脂肪沉积过程中定量PCR内参基因的筛选

Chinese Journal of Veterinary Science(2020)

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摘要
通过筛选小鼠不同类型脂肪组织及脂肪细胞诱导分化过程中的最佳内参基因,为研究小鼠脂肪沉积过程中基因相对定量表达水平提供依据.首先利用荧光定量PCR技术检测9个候选内参基因在脂肪组织及脂肪细胞诱导分化过程中的表达并构建标准曲线,然后通过RefFinder程序评估内参基因的稳定性并确定最稳定的内参基因,最后以筛选的稳定内参基因进行不同类型脂肪组织组蛋白去甲基化酶KDM2A的相对定量表达,并与KDM2A的绝对定量结果比较,评价筛选内参基因的定量效果.结果显示,RPL13a和18S rRNA分别是小鼠脂肪组织和脂肪细胞中表达最稳定的内参基因,而ACTB不适合作为小鼠脂肪沉积过程中的内参基因.采用RPL13a作为内参基因的KDM2A相对定量结果显示,KDM2A在附睾脂肪组织(eWAT)具有较高的表达量,棕色脂肪组织(BAT)次之,与KDM2A在不同类型脂肪组织的绝对定量结果一致.因此,RPL13a和18S rRNA可作为小鼠脂肪组织及脂肪细胞基因相对定量的最适内参基因.
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