昆明市某猪场猪戊型肝炎病毒流行情况调查

Journal of Yunnan Agricultural University(2020)

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Abstract
[目的]了解昆明市某猪场戊型肝炎病毒感染情况,进一步探究病毒基因型及分子进化情况,为戊型肝炎防控提供参考.[方法]从该猪场随机采集39份新鲜粪便,用逆转录巢式聚合酶链反应对HEVORF2部分基因片段扩增、克隆及测序;应用生物信息学软件进行同源性分析并构建系统进化树.[结果]PCR检测结果发现:该猪场核酸阳性率达35.9%(14/39).同源性分析结果表明:14株流行毒株核苷酸序列与GenBank中HEVⅠ~Ⅳ 型参考株的同源性分别为77.4%~83.9%、81.0%~83.2%、78.8%~86.9%和90.5%~98.5%,全部流行株均属基因Ⅳ型.进化分析结果表明:YN-KM-9与该猪场其他流行毒株同源性较远,应属不同基因亚型.[结论]该猪群HEVⅣ感染率较高,对公共卫生安全构成潜在威胁.
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