鸡GATA基因家族鉴定及生物信息学分析

MENG Jie, WANG Chuang,YANG Qing,ZHANG Bei,LI Keqiang,ZHANG Chuansheng,GENG Liying,LI Xianglong

Journal of Henan Agricultural Sciences（2021）

引用 0|浏览14

暂无评分

摘要

为了解鸡GATA (ChGATA)家族基因特性,利用生物信息学方法对ChGATA基因家族成员进行鉴定,分析其理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、进化关系、蛋白质结构及蛋白质互作关系.结果表明,共鉴定出6个ChGATA基因,不均匀地分布在5条染色体上.根据蛋白质保守结构域命名为ChGATA2-ChGATA6和ChTRPS1.理化性质分析结果显示,ChGATA均为无稳定的亲水蛋白质,且除ChTRPS1外均为碱性蛋白质.二级结构预测分析结果显示,ChGATA主要由无规则卷曲组成.保守结构域分析结果显示,ChGATA均包含ZnF_GATA结构域.系统进化分析结果显示,ChGATA基因家族可分为3个亚群,且同一亚群的基因结构相似、蛋白质三级结构相似、相互作用蛋白质较一致、亲缘关系较近.

AI 理解论文

溯源树

样例

生成溯源树，研究论文发展脉络

Chat Paper

正在生成论文摘要