产胞外多糖嗜热链球菌eps基因簇的表达及生物信息学分析

目的:胞外多糖(EPS)作为乳酸菌(LAB)重要的次级代谢产物,在发酵乳制品的生产中发挥着重要作用.采用生物信息学方法分析乳酸菌产EPS的分子机制,为开发利用EPS提供理论依据.方法:采用二代测序技术(Illumina Hiseq 4000)及实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)对分离自蒙古国酸牛奶中一株高产EPS的嗜热链球菌IMAU20756进行基因组测序,并对不同时间点eps基因表达量进行定量分析.结果:该菌株基因组全长为1838440 bp,GC含量为38.8％,共编码2120个基因,包含1962个功能基因,36个tRNA、515个假基因、1个tmRNA和2个重复单位.其中和EPS生产相关的基因有12个,epsA、epsB是调控基因,epsC、epsD决定多糖链长,eps1E、eps2E、epsG、epsF、epsH、epsI、epsJ是编码糖基转移酶基因,epsK调控多糖聚合及输出.结论:所有和EPS生物合成相关的基因在发酵过程中均能表达,特别是糖基转移酶的基因表达量在发酵6h时达最高.