多西环素对黄牛肠道微生物菌群多样性和功能预测的分析研究

为了研究多西环素对黄牛肠道微生物菌群结构和多样性的影响,试验随机选取3头健康黄牛,每天清晨饲喂后1小时,按体重灌服多西环素15 mg/kg,连续7d,分别在灌药当天及灌药结束后的第2天清晨空腹采集直肠粪样.采用自身对照法,利用16S RNA测序技术提取样品中基因组DNA,分别对两次采集的粪便构建测序文库并进行Illumina MiSeq测序,进行生物信息学分析、样本复杂度分析和多样本比较分析,利用Tax4Fun程序进行功能注释和预测.结果 表明:多西环素可降低黄牛肠道菌群的丰度和多样性,厚壁菌门相对丰度比灌服多西环素前有所增加,拟杆菌门相对丰度比灌服多西环素前有所减少.在门水平上,浮霉菌门和柔壁菌门丰度显著或极显著降低(P＜0.05或P＜0.01);属水平上拟杆菌属和产己酸菌属的丰度显著增加(P＜0.05).饲喂多西环素之后,在膜运转、复制与修复、辅酶因子和维生素代谢、新陈代谢、碳水化合物代谢、耐药性、传染病、内分秘系统等方面的功能基因代谢通路丰度上升.说明多西环素可以降低肠道微生物的相对丰度和多样性,改变代谢通路二级功能层的相对丰度.