斑鸠霉素调节PANC-1细胞系的糖酵解过程

目的 胰腺癌是恶性腹部肿瘤,以5年生存率奇低,致死率非常高为特征.文章基于生物信息学方法挖掘生物医学数据库数据,识别Ikarugamycin(斑鸠霉素)作用于胰腺导管腺癌(PDAC)的潜在靶标基因.方法 从基因表达汇编(GEO)数据库中下载数据集GSE120713,通过R软件对数据进行校正并鉴定差异表达基因(DEGs),绘制火山图和热图,并对鉴定出的DEGs进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析.然后,利用STRING网站和Cytoscape软件对DEGs进行蛋白质相互作用分析,借助Cytohubba插件识别出10个hub基因.最后,分别在GEPIA2和Kaplan-Meier Plotter网站上验证这些hub基因的表达及预后情况.结果 GEPIA2和Kaplan-Meier Plotter的结果提示:DDIT3、GADD45A、LOX、MMP1、SERPINE1和TXNIP同时满足在PC中表达及预后均有统计学意义,被确定为hub基因.结论 斑鸠霉素可能通过下调DDIT3或LOX的表达,参与PANC-1细胞系糖酵解过程,从而发挥对PANC-1细胞的抑制作用,该研究有助于发现斑鸠霉素治疗PDAC的潜在机制.