植物乳杆菌p-8亚油酸异构酶系的氨基酸序列及同源建模分析

利用生物信息学相关服务器分析植物乳杆菌p-8的亚油酸异构酶系的CLA-HY、CLA-DH、CLA-DC和CLA-ER的一级和二级结构,预测了其亲疏水性、跨膜区域、信号肽和磷酸化位点,构建了CLA-HY、CLA-DH、CLA-DC和CLA-ER蛋白家族的系统进化树并进行同源建模分析了其三维结构.结果 表明,4个蛋白均呈酸性,亲水;二级结构均以α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲为主;CLA-HY为细胞膜内侧上的外周膜蛋白,其他3个为胞质内的可溶蛋白;CLA-DH为同源6聚体,构成一个腔体结构;CLA-DC为同源12聚体,每个亚基为Westheimer折叠结构;CLA-ER是一个同源二聚体结构.本研究为亚油酸异构酶系相关酶的空间结构、催化活性位点的研究和工业化生物合成CLA的酶改造奠定基础.