DNA条形码在鰤属鱼类物种鉴定和系统进化分析中的适用性

为了探讨线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ、Ⅱ(COⅠ、COⅡ)和16SrRNA基因在鰤属鱼类物种鉴定和群体划分中的适用性,在黄条鰤(Seriola lalandi)、高体鰤(Seriola dumerili)、五条鰤(Seriola quinqueradiata)等鰤属鱼类中克隆了 3种基因,并进行序列比对与系统进化分析.结果显示,COⅠ、COⅡ和16SrRNA的基因序列均表现出明显的A+T偏倚性;16S rRNA序列最为保守,变异率仅为5.06％;CO Ⅰ序列的平均核苷酸差异数(k)和核酸多样性指数(Pi)高于CO Ⅱ和16S rRNA,CO Ⅱ的单倍型多样性指数最高,CO Ⅰ序列分化程度更高.比较了鰤属鱼类3种基因的扩增序列,发现COⅠ、CO Ⅱ和16S rRNA均能对我国分布的3种鰤属鱼类进行有效鉴别.另外,COⅠ、COⅡ还可作为不同地理群体黄条鰤的鉴别DNA条形码,而16S rRNA对于不同地理群体的黄条鰤辨识能力不足.在鰤属鱼类中,基于COⅠ、COⅡ、16S rRNA基因计算的种间遗传距离都大于种内遗传距离的10倍以上,系统进化分析显示每个物种都形成单系,表明COⅠ、COⅡ、16S rRNA基因不仅可作为鰤属鱼类物种鉴定和多样性保护的有效DNA条形码,CO Ⅰ、CO Ⅱ还可作为黄条鰤不同地理种群划分和国际资源判别的依据.