NeW mutatioN oF tHe tp53 geNe associated WitH tHe HeReditaRY BReast caNceR iN a YouNg

semanticscholar(2022)

引用 0|浏览5
暂无评分
摘要
Введение. Проблема идентификации в российских популяциях этноспецифических мутаций, ассоциированных с наследственными формами рака молочной железы, остается открытой. Технология высокопроизводительного секвенирования является методом выбора, однако существуют сложности интерпретации полученного массива данных при аннотировании их с использованием общепринятых баз данных. Так, для малоизученных популяций от 20 % молекулярных тестов сообщают о генетических вариантах неизвестного значения (Vus) или новых вариантах, которые ранее не были описаны. Для получения расширенной информации о вариантах высокопроизводительного секвенирования неизвестного значения необходимо использовать альтернативные подходы анализа данных. Материал и методы. Проведена реклассификация мутации неизвестного значения гена ТР53 с использованием базы данных activedrivedB, которая оценивает влияние мутаций на сайты посттрансляционных модификаций, и инструмента proteinpaint, который обеспечивает всестороннее и интуитивно понятное представление о геномных данных. Результаты. Мутация гена tp53 (rs1555526933) была обнаружена у молодой тувинки 44 лет с диагнозом РМЖ. В базе данных dbpubmed (rs1555526933, chr17:7579716, g>a, pro27leu) эта мутация является вариантом неизвестного значения (unknown significance) с отсутствием информации о частоте встречаемости минорного аллеля. Согласно данным инструмента activedriverdB, эта мутация расположена дистально в сайте посттрансляционной модификации белков, отвечающем за связывание с киназами, регулирующими гены клеточного цикла и др. (atm, cHeK2, cdK, mapK). Согласно данным proteinpoint, эта мутация находится в кодоне, где ранее была описана патогенная мутация гена tp53 p.leu26glnfster4 (Nm_000546.6 (tp53): c.77_80delinsaagaacgt (p.leu26fs), приводящая к формированию синдрома Ли – Фраумени (группа редких наследственных опухолевых заболеваний). Заключение. Впервые у пациентки (тувинский этнос) с ранним началом РМЖ и отягощенным онкологическим анамнезом описан вариант гена tp53 (rs1555526933), который может быть связан с синдромом наследственной предрасположенности к РМЖ, включая синдром Ли – Фраумени. Ключевые слова: наследственные мутации, рак молочной железы, малые народы России, этносы,
更多
查看译文
AI 理解论文
溯源树
样例
生成溯源树,研究论文发展脉络
Chat Paper
正在生成论文摘要