四川省眉山市六个柑橘品种上衰退病毒分离株的组群构成、基因型及遗传特征

为有效利用弱毒株系交叉保护(mild strain cross protection,MSCP)防控柑橘衰退病,分别采用限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)、双向逆转录-聚合酶链式反应(bi-directional reverse transcription polymerase chain reaction,BD-PCR)及多重分子标记对四川省眉山市6个柑橘品种30个样品上的柑橘衰退病毒(citrus tristeza virus,CTV)分离株进行组群构成、基因型、遗传特征和系统发育树分析.结果 表明,在30个柑橘样品中,70.0％的样品为多种CTV组群混合侵染,且多为强毒和弱毒株系混合侵染;6个柑橘品种上CTV组群构成存在差异,温州蜜柑品种主要为组群1和组群3混合侵染,纽荷尔脐橙品种均为组群3和组群5混合侵染,其他4个品种主要为组群3和组群5混合侵染和组群3单一侵染.6个柑橘品种上CTV分离株均由3～5种基因型构成,构成较相似,均包括T3、T30、T36三种基因型,而不知火品种上未检出B165基因型.6个柑橘品种上CTV分离株的核苷酸序列相似性较高,介于92.4％～99.8％之间;遗传分化系数介于-0.114～0.467,基因流介于-35.89～52.92之间,其中纽荷尔脐橙CTV种群与除沃柑外其他品种的CTV种群的分化系数均大于0.281,基因流均小于1.00,表明这6个柑橘品种CTV种群之间存在基因交流,但纽荷尔脐橙CTV种群与其他品种交流不频繁;所有CTV分离株均被聚为3个不同的类群,其中春见、蜜柑、爱媛品种上大部分CTV分离株被聚为类群Ⅰ,纽荷尔脐橙品种上所有CTV分离株被聚为类群Ⅱ,而沃柑、不知火品种上大部分CTV分离株被聚为类群Ⅲ;CTV种群间变异百分比为80.86％,表明寄主品种是CTV分离株p25基因遗传分化的重要因素.