建兰种质资源遗传多样性分析及核心种质构建

研究记录了311份建兰(Cymbidium ensifolium)种质资源的萼片、花瓣、唇瓣颜色以及叶艺、瓣型和唇瓣斑点等质量性状的表型特征,并对其进行赋值和统计分析;利用22对SSR荧光引物对311份建兰种质资源进行PCR扩增,分析其遗传多样性;利用Structure软件分析建兰种质资源的群体结构,采用主成分分析和聚类分析进行验证;运用Core Finder软件和t检验分析并筛选核心种质.结果 表明:311份建兰种质资源的6个质量性状的表型遗传多样性均大于0.5,表明建兰种质资源的表型具有丰富的遗传变异;22对SSR荧光引物共检测到171个等位基因(Na),平均有效等位基因数(Ne)为2.729,Shannon's信息指数(Ⅰ)为1.026,表明建兰种质资源具有丰富的遗传多样性;Structure软件分析结果显示最优的群体数K值为3,群体间有少量种质混杂;群体结构分析将建兰种质资源分为3个类群,主成分分析和聚类分析进一步验证了其分类的可靠性.本研究中构建的建兰核心种质51份占原有种质资源的16.4％,等位基因数(Na)保留率为100％,有效等位基因数(Ne)保留率为130％,Shannon's信息指数(Ⅰ)保留率为124％.通过f检验和主坐标分析发现,核心种质与原有种质的遗传多样性无显著差异,说明构建的51份核心种质能最大程度代表建兰种质资源的遗传多样性.