大白菜花茎蜡粉近等基因系转录组分析

Acta Horticulturae Sinica(2022)

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摘要
为研究大白菜花茎蜡粉分子调控机制,针对大白菜一对花茎蜡粉差异的近等基因系进行了转录组比较分析.在有蜡粉材料RHL0651和无蜡粉材料RHL0652之间总共鉴定到7237个基因存在显著差异表达,主要富集在碳水化合物生物过程、原生质膜的组成成分和四吡咯结合分子功能.结合基因功能注释,筛选到17个蜡粉相关基因,包括蜡粉合成基因MAH1、CYTB5-B (Bra022898,Bra021809)、KCS6/CER6/CUT1、KCS9、FAR3/CER4、KCS1、CER2、KCD/PAS2、CYTB5-C (Bra039268,Bra004518)、CER2-LIKE,蜡粉转运基因LTPG1 (Bra010912,Bra030067)和转录因子基因WIN1/SHINE1、MYB30、DEWAX在两自交系间存在显著差异表达,其可能参与了大白菜花茎表皮蜡粉形成.利用qRT-PCR验证了转录组分析的可靠性以及差异表达基因在不同组织的表达模式.研究结果有助于进一步克隆大白菜蜡粉调控基因和开发相关功能分子标记.
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