芍药属远缘杂交不亲和PlABCF3基因克隆及表达分析

为进一步研究PlABCF3基因在芍药属远缘杂交不亲和中的作用机制,根据转录组测序结果,采用RT-PCR技术在芍药粉玉奴自交和芍药粉玉奴×牡丹凤丹白杂交24,36 h的柱头中克隆到1个ABCF3基因(PlABCF3).生物信息学和表达特性分析表明,PlABCF3的CDS全长为2 151 bp,编码716个氨基酸.芍药ABCF3的碱基序列与拟南芥ABCFs进行同源序列分析表明,其与AtABCF3具有较高的同源性.系统进化分析表明,PlABCF3与博落回的ABCF3同源性最高,P1ABCF3氨基酸序列与博落回的ABCF3的相似性最高,故命名为PlABCF3(GenBank登录号:MT123594).RT-qPCR分析表明,在不同时期的自交、杂交柱头中,PlABCF3基因在相同处理条件下,36 h的相对表达量均低于24 h,杂交36 h相对表达量最低.PlABCF3的相对表达量与脱落酸(ABA)、玉米素核苷(ZR)含量显著负相关(R分别为-0.837,-0.565,P＜0.01).说明PlABCF3基因在芍药属远缘杂交中与内源激素有着密切的关系.