利用重组自交系定位水稻种子低氧发芽力QTL

鉴定低氧发芽力强的水稻资源,进而挖掘控制低氧发芽的QTL,可以为改良直播稻低氧发芽能力提供材料基础和基因资源.在装满无菌水的10 cm高的离心管中鉴定了云南省籼稻地方品种扎西玛、江苏省优良食味粳稻品种南粳46及包含135个家系的扎西玛/南粳46 RIL群体的低氧发芽力.以28℃黑暗培养7d的胚芽鞘长度作为低氧发芽力的评价标准.结果 表明:在淹水7d后,扎西玛和南粳46胚芽鞘长度分别为2.92,6.68 cm,二者在P=0.01水平上存在极显著差异.进而对扎西玛/南粳46 RIL群体135个家系低氧发芽力QTL分析发现,在水稻第12号染色体上的RM1300和RM1227之间检测到一个控制低氧发芽力的QTL(qAG-12).该QTL的LOD值为3.04,可以解释11.24％的表型变异.生物信息学分析表明,qAG-12位于第12染色体上26.00～27.34 Mb的1.34 Mb范围内.该区域共有200多个注释基因,未见已报道控制低氧发芽力的QTL.以上结果表明:扎西玛和南粳46低氧发芽力存在极显著差异;qAG-12是一个新的控制低氧发芽力的QTL.