鸭疫里默氏杆菌CAMP基因的克隆、原核表达及生物信息学分析
China Animal Husbandry & Veterinary Medicine(2021)
摘要
试验旨在克隆鸭疫里默氏杆菌协同溶血素蛋白(cooperative hemolysin protein,CAMP)基因,并对其进行原核表达和生物信息学分析.以RA贵州血清2型分离株RA-SS-8基因组为模板扩增并克隆鸭疫里默氏杆菌CAMP基因,构建pET-28a-CAMP重组原核表达质粒,转化大肠杆菌Rosetta(DE3)感受态细胞,重组菌用IPTG进行诱导表达及纯化,利用SDS-PAGE和Western blotting分析表达蛋白的特征,并运用相关生物信息学分析软件对CAMP基因进行分析.结果 显示,鸭疫里默氏杆菌CAMP基因大小为1026 bp,该基因序列与GenBank中公布的10株RA参考菌株(如RA-LZ01 (CP045564.1))CAMP基因的相似性达99.7%.经BamH I和Xho I双酶切鉴定后,获得大小约5369和1026 bp的基因片段,表明pET-28a-CAMP重组表达质粒构建成功.SDS-PAGE和Western blotting分析显示,表达的重组蛋白大小约为37 ku,以可溶形式进行表达,且能与His-tag单克隆抗体在37 ku处产生特异性反应,与预期结果相符.生物信息学分析表明,CAMP蛋白分子式为C1670H2659N37O500S12,含341个氨基酸,理论等电点(pI)为5.62,不稳定系数为40.71,表明其为不稳定的弱酸性蛋白.疏水性预测结果显示,该蛋白属于亲水性蛋白.CAMP蛋白无跨膜结构域,无信号肽,有3个O-糖基化位点,无N-糖基化位点,存在34个磷酸化位点,共有17个抗原表位.二级结构和三级结构预测结果显示,CAMP蛋白以a-螺旋和无规则卷曲为主.本试验结果为进一步研究鸭疫里默氏杆菌CAMP蛋白的功能及鸭疫里默氏杆菌病疫苗的研发提供了参考.
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