隆林山羊SMPX基因克隆及其组织表达谱分析
Chinese Journal of Animal Science（2022）
Abstract
为了探究小肌肉蛋白(Small Muscle Protein X-link,SMPX)在隆林山羊中的蛋白结构和组织表达水平,本研究克隆隆林山羊SMPX,并进行生物信息和组织表达谱分析.从NCBI查找山羊SMPX基因序列设计引物,根据TRlzol法提取1月龄隆林山羊心、肝、脾、肺、肾、背肌的总RNA,反转录成cDNA,并克隆SMPX,通过qRT-PCR分析SMPX在不同组织中的表达水平,进行生物信息学分析.SMPX基因编码区序列全长253 bp,共编码255个氨基酸,与NCBI上山羊编码区序列同源性达100％.SMPX蛋白的分子质量20.61 ku,等电点为5.29,是酸性蛋白,其在1～22个氨基酸处具有信号肽.SMPX有11个磷酸化位点,在隆林山羊不同组织中的表达量不一样,推测它可能在不同组织中发挥不同的生物学作用.
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