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Intérêt Du Séquençage De Nouvelle Génération (SNG) Dans Le Diagnostic Différentiel Des Polykystoses Rénales Et/ou Hépatiques

Néphrologie & Thérapeutique(2021)

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Abstract
IntroductionLa PKRAD est marquée par une hétérogénéité génétique. En plus de PKD1 et PKD2, codant les polycystine 1 et 2, de nouveaux gènes impliqués dans la biogenèse de ces protéines ont récemment été identifiés.DescriptionNous évaluons l’apport du SNG dans le diagnostic des maladies hépatorénales kystiques, au sein d’une cohorte de 269 patients issus de la cohorte Genkyst (n=195) ou référés pour analyse au laboratoire de génétique moléculaire (n=74).MéthodesDesign d’un panel SNG de 25 gènes (Roche Nimbelgen), séquençage MiniSeq (Illumina). Annotation et filtrage des variants à l’aide des logiciels SVS de Golden Helix et SeqOne.RésultatsL’analyse de 269 individus non apparentés, dont la plupart avaient eu une analyse PKD1/PKD2 négative, a permis d’établir un diagnostic chez 39 patients (14,5 %). Un diagnostic différentiel a été établi pour 21 patients. Huit individus présentaient une mutation d’ALG8, codant la α-1,3-glucosyltransferase et décrit jusqu’alors dans la polykystose hépatique. Ces patients n’avaient pas de néphromégalie et des fonctions rénales conservées. Une mutation d’ALG9, codant la alpha-1,2-mannosyltransferase a été mise en évidence chez un homme de 65 ans ayant un DFG à 52mL/min/1,73m2 et des reins polykystiques de grande taille. Le diagnostic de syndrome HANAC, par mutation du gène COL4A1 a été porté chez un homme de 70 ans, ayant un DFG à 40mL/min/1,73m2, un antécédent de porencéphalie, et des douleurs musculaires diffuses. Le diagnostic de syndrome oro-facio-digital de type 1 a été porté chez deux patientes, avec des implications importantes en termes de conseil génétique compte tenu du mode de transmission liée à l’X. Enfin, 6 cas de formes mineures par mutations hétérozygotes de PKHD1, deux polykystoses récessives, et un cas de néphropathie-DNAJB11 ont été identifiés.ConclusionEn cas de présentation clinique atypique, d’histoire familiale négative, le diagnostic génétique doit être demandé, compte tenu des implications potentielles en termes pronostique, thérapeutique et parfois de conseil génétique.
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