Assessment of genetic diversity of Mithun (Bos frontalis) population in Bhutan using microsatellite DNA markers

Animal Genetic Resources Information = Bulletin de information sur les ressources génétiques animales = Boletín de información sobre recursos genéticos animales(2016)

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摘要
espanolSe estudio la diversidad genetica de la poblacion de gayales en Bhutan, utilizando para ello 14 marcadores microsatelites. Se llevaron a cabo dos tandas de reacciones en cadena de la polimerasa (PCR, por sus siglas en ingles) de dos pasos con multiples marcadores y con marcadores individuales para genotipificar 105 muestras de pelo tomadas de Arong en Samdrupjongkhar (AS, 36) y de Wangdigang en Zhemgang (WZ, 69). Se detectaron 53 alelos, con una media de 3.89 alelos y un contenido de informacion polimorfica de 0.44 ± 0.03 por locus. Se constato un bajo nivel de variabilidad genetica dentro de la poblacion, con una heterocigosis observada de 0.50 ± 0.06 y una heterocigosis esperada de 0.48 ± 0.06. El analisis de varianza molecular (AMOVA) atribuyo el 58 por ciento de la variacion total a la variabilidad intraindividual. Los valores medios para los coeficientesFST,FISyFITfueron de 0.054,−0.056 y 0.005, respectivamente, lo cual refleja un bajo nivel de diferenciacion en la poblacion y una escasez de cruzamientos exogamicos. La distribucion tipica en forma de L de las frecuencias alelicas, sin ninguna distorsion, puso de manifiesto la ausencia de cuellos de botella geneticos recientes en las poblaciones de gayales. Por tanto, para gestionar la endogamia en la pequena poblacion de gayales de Bhutan, se recomienda una evaluacion periodica de los niveles de consanguinidad y el intercambio de animales entre las granjas con el fin de recudir la frecuencia de las importaciones desde la India. Palabras clave: diversidad genetica, gayal, analisis de varianza molecular (AMOVA), marcadores microsatelites de ADN EnglishGenetic diversity of Mithun population in Bhutan was studied using 14 microsatellite markers. Two sets of two-step polymerase chain reactions were performed with multiplex and individual markers for genotyping 105 hair samples collected from Arong in Samdrupjongkhar (AS, 36) and Wangdigang in Zhemgang (WZ, 69). Fifty-three alleles were detected with average of 3.89 alleles and polymorphism information content of 0.44 ± 0.03 per locus. A low level of genetic variability within population was present with observed heterozygosity at 0.50 ± 0.06 and expected heterozygosity at 0.48 ± 0.06. Analysis of molecular variance attributed 58 percent of total variation to within the individuals. MeanFIS andFITwere−0.056 and 0.005 respectively, indicated low level of population differentiation and limited out-breeding. The normal L-shaped distribution of allelic frequencies without any mode-shift revealed the absence of recent genetic bottleneck in Mithun populations. Therefore to manage inbreeding in the small Mithun population of Bhutan, periodic assessment of inbreeding levels and exchange of animals between farms is recommended to reduce frequency of introduction of animals from India. Keywords: Genetic diversity, Mithun, analysis of molecular variance (AMOVA), microsatellite DNA marker francaisLa diversite genetique de la population de gayals au Bhoutan a ete etudiee en utilisant 14 marqueurs microsatellites. Deux series de reactions en chaine par polymerase (PCR selon ses sigles en anglais) en deux etapes ont ete realisees avec plusieurs marqueurs et avec des marqueurs individuels pour genotyper 105 echantillons de poils preleves a Arong au Samdrup Jongkhar (AS, 36) et a Wangdigang au Zhemgang (WZ, 69). Cinquante-trois alleles ont ete detectes pour une moyenne de 3.89 alleles et un contenu d’information sur le polymorphisme de 0.44 ± 0.03 par locus. Un faible niveau de variabilite genetique a ete observe au sein de la population avec une heterozygotie observee de 0.50 ± 0.06 et une heterozygotie attendue de 0.48 ± 0.06. L’analyse de variance moleculaire (AMOVA) a attribue le 58 pour cent de la variation totale a la variabilite intra-individuelle. Les valeurs moyennes des coefficients FST, FIS et FIT ont ete de 0.054, −0.056 et 0.005 respectivement, ce qui est le reflet d’un faible niveau de differenciation dans la population et d’un manque de croisements exogames. La distribution habituelle des frequences alleliques en L, sans aucune distorsion, a decele l’absence de goulots d’etranglement genetique recents dans les populations de gayals. Ainsi, afin de gerer la consanguinite dans la petite population de gayals du Bhoutan, une evaluation periodique des niveaux de consanguinite et un echange d’animaux entre les fermes sont conseilles pour reduire la frequence des importations depuis l’Inde. Mots-cles: diversite genetique, gayal, analyse de variance moleculaire (AMOVA), marqueurs microsatellites d’ADN
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关键词
genetic diversity,bhutan,mithun
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