Prospecção de candidatos a fármacos para tratamento de tumores malignos

Introducao: A principal caracteristica do câncer e o crescimento descontrolado de celulas neoplasicas, formando tumores. Tecidos tumorais apresentam dependencia do aminoacido L-asparagina para se desenvolver, sendo a obtencao desse aminoacido feita do meio extracelular. Alguns medicamentos quimioterapicos hidrolisam a asparagina em amonia e aspartato, eliminando a fonte serica de asparagina das celulas tumorais, causando uma apoptose seletiva. Esse efeito e possivel pela presenca da enzima asparaginase utilizada como principio ativo dos medicamentos anticancerigenos. Ess molecula e isolada principalmente da bacteria E.coli, porem pacientes tem apresentado efeitos colaterais ao uso de medicamentos que a contem, sendo necessarias novas alternativas farmacologicas. Objetivo: Realizar analise in silico do potencial biotecnologico de asparaginase de Erwinia billingiae, a partir da construcao 3D da proteina, identificacao do sitio ativo e validacao do modelo proposto. Materiais e metodos: Foi realizada uma busca a partir da sequencia FASTA da L asparaginase de Erwinia billingiae no Protein Data Bank (PDB), para aquisicao de um molde proteico. Posteriormente foi realizado o alinhamento entre as sequencias alvo e molde. Foram construidos cinco modelos proteicos no progama modeller 9v8, e estes foram submetidos a validacao atraves do diagrama de Ramachandran, QMEAN, Prosa e ProQ. Resultados: Foi escolhido o PDB 4O0E para ser utilizado como referencia para gerar os candidatos a farmaco, sendo construido diversos modelos, validados e escolhido aquele com melhores resultados. O modelo proposto possui 320 aminoacidos, sendo sua estrutura secundaria caracterizada por 11 ẞ-folhas, 8 α-helices e 20 loops, todos equivalentes as estruturas do modelo de referencia (4O0E). Foi observada a presenca da triade catalitica T168, T186 e T219 do modelo de referencia em posicoes equivalentes no modelo construido, sugerindo conservacao de sua funcao. Conclusao: A asparaginase de Erwinia billingiae mantem a triade catalitica de treoninas conservada sugerindo preservacao de sua funcao proteolitica. Estudos adicionais de acoplamento e dinâmica molecular devem ser realizados para observar se ocorrem interacoes no complexo enzima-substrato.