Analyse génétique de la « fromageabilité » du lait de vache prédite par spectrométrie dans le moyen infrarouge en race Montbéliarde

Les aptitudes du lait a la transformation en fromage sont etroitement liees a sa composition. Ces caracteres, difficiles a mesurer directement, ont ete predits a partir des spectres dans le moyen infrarouge (MIR) du lait en race Montbeliarde (projet From’MIR). Cet article rassemble les resultats de l’analyse du determinisme genetique des aptitudes fromageres et de la composition fine du lait, predites a partir de six millions de spectres MIR de 400 000 vaches. Ces caracteres sont moderement a fortement heritables et les correlations genetiques entre caracteres fromagers (rendements et coagulation) et avec la composition du lait (proteines, acides gras et mineraux) sont elevees et favorables. Des analyses d’association (GWAS) et de reseaux de genes, realisees a partir des genotypes imputes pour l’ensemble des variations du genome de 20 000 vaches, permettent d’identifier des genes et des variants candidats ainsi qu’un reseau de 736 genes impliques dans des voies metaboliques et des genes regulateurs fonctionnellement lies a la composition du lait. Enfin, l’estimation de la precision d’une evaluation genomique montre qu’un modele de type controles elementaires, incluant les variants detectes par les GWAS et presumes causaux, permet de predire des valeurs genomiques precises. Nous avons par ailleurs simule une selection incluant les aptitudes fromageres qui montre les possibilites de selectionner efficacement les vaches pour qu’elles produisent un lait plus « fromageable », avec un impact limite sur le gain genetique des caracteres actuellement selectionnes. Ces resultats ont conduit a la mise en place d’un prototype d’evaluation genomique en race Montbeliarde dans la zone AOP Comte en 2019