Establishment of Elution and Concentration Procedure for Rapid and Sensitive Detection of Norovirus in Foods of Diverse Matrices
Journal of Food Hygiene and Safety(2015)
摘要
본 연구는 다양한 식재료가 섞여있는 식품으로부터 노로바이러스를 효과적으로 검출하기 위한 시험법 개발에 관한 것이다. 각 식품이 가진 매트릭스가 매우 다르므로 모든 식품에 공통적으로 적용할 수 있는 표준화된 검출법이 현재로서는 없다. 본 연구에서는 발효식품(농후발효유, 된장), 절임식품(깻잎장아찌, 단무지)과 생식제품을 대상으로 실험을 진행하였다. PBS, beef extract, 아미노산-NaCl 용액 등을 이용하여 바이러스에 오염된 대상식품들로 부터 바이러스의 탈리율을 비교하였다. 이로부터 다양한 매트릭스가 혼합된 식품들에 적용 가능한 탈리용액을 선별하였다. 식품의약품안전처가 제안하여 현재 국내에서 굴, 야채, 과일 등을 대상으로 바이러스 농축에 널리 사용되고 있는 식중독 바이러스 검출법인 EPCP공정(탈리-PEG 침전-클로르포름 처리-PEG 침전)과 PEG 침전과정을 한번으로 줄인 수정된 ECP공정(탈리-클로르포름 처리-PEG침전)의 효능을 비교해 본 결과 ECP공정은 EPCP공정과 비슷하거나 나은 효율로 바이러스를 농축할 수 있었다. 또 바이러스 농축 후 QIAamp$^{(R)}$ Viral RNA Mini kit를 이용하여 RNA를 추출할 경우 식품에 존재하는 RT-PCR방해 물질들이 효과적으로 제거되어 추가적인 처리가 더 필요하지 않음을 알 수 있었다. 수정된 공정을 이용하여 무를 추가한 6가지 식품을 대상으로 검출한계를 조사해 본 바 10-25 g 식품으로부터 3.125-12.5 RT-PCR unit까지 검출이 가능하였다. 이는 기존에 보고된 방법들의 검출한계보다 더 우수한 것으로 장차 다양한 식품을 대상으로 효과적인 바이러스 검출이 가능할 것으로 기대된다. This article reports the development of an effective test procedure for detection of norovirus (NoV) in foods of diverse matrices. In this study, target foods included fermented milk, soybean paste, powders made from uncooked grains and vegetables, sesame leaves preserved in soy sauce, pickled mooli, and mooli. Viral recovery varied depending on the food matrices or elution buffers tested. Buffers were compared to determine effective elution buffers from artificially virus-contaminated foods. The conventional test procedure for concentrating viruses from food (elution-polyethylene glycol(PEG) precipitation-chloroform-PEG precipitation) was modified to save time by eliminating one PEG precipitation step. The modified procedure (elution-chloroform-PEG precipitation) was able to concentrate viruses more effectively than the conventional procedure. It also removed RT-PCR inhibitors effectively. The modified procedure was applied to target food for genogroup II NoV detection. NoV RNA was detected at the initial inoculum levels 3.125-12.5 RT-PCR units per 10-25 g tested food. The use of this newly established procedure should facilitate detection of low levels of norovirus in diverse foods.
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