基于生物信息学分析筛选参与肾脏纤维化的关键基因和通路

International Journal of Transplantation and Hemopurification(2021)

引用 0|浏览11
暂无评分
摘要
目的:寻找肾脏纤维化发生的关键基因和潜在机制,为肾脏纤维化早期诊断和治疗提供评估手段和新思路。方法:在基因表达综合数据库(GEO数据库)中进行搜索找出信息芯片GSE102515,筛选出差异基因,找出下调基因和上调基因。通过DAVID数据库对肾脏纤维化发展过程中的差异基因进行富集分析,利用STRING数据库和Cytoscape软件分析差异基因,进行可视化处理。结果:筛选出27个上调基因和322个下调基因。差异基因主要参与整合素介导的信号通路、有丝分裂姐妹染色单体结合等,差异基因分子功能主要为磷脂结合、调控区DNA结合等,差异基因细胞组分主要与低密度脂蛋白颗粒、核等相关。筛选发现ADM、ARRB1、AVPR2、CCR1、MTNR1A、PTH、S1PR2是肾脏纤维化风险相关蛋白相互作用网络中的核心基因。结论:通过对数据集进行分析,筛选出肾脏纤维化发生过程中的差异基因,发现ADM、ARRB1、AVPR2、CCR1、MTNR1A、PTH、S1PR2可能为肾脏纤维化发展过程中的重要参与者,为寻找有价值的肾脏纤维化标志物提供了数据分析支持。
更多
查看译文
关键词
Renal fibrosis,GEO database,Key genes,Protein interaction network
AI 理解论文
溯源树
样例
生成溯源树,研究论文发展脉络
Chat Paper
正在生成论文摘要