2017—2018年西安市手足口病病原构成及肠道病毒71型分子特征分析

目的:了解2017—2018年西安市手足口病病原谱构成情况以及肠道病毒71型(enterovirus 71，EV-A71)VP1的基因特征。方法:采集2017—2018年西安市手足口病哨点医院HFMD患者肛拭子标本1 735例，采用实时荧光定量PCR鉴别EV-A71、柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus 16，CV-A16)和其他肠道病毒。分离培养部分EV-A71毒株，采用一步法逆转录-聚合酶链反应对VP1区进行基因扩增及测序，与本地区既往毒株进行同源性比对及遗传进化分析。结果:共检测到肠道病毒核酸阳性样本1 565例，阳性率为90.20%(1 565/1 735)，其中EV-A71核酸阳性占24.79%(388/1 565)，CV-A16核酸阳性占21.85%(342/1 565)，其他肠道病毒核酸阳性则占53.36%(835/1 565)。2017年与2018年的主要病原分别是EV-A71(45.08%)与其他肠道病毒(73.38%)，病原构成差异有统计学意义( χ2＝370.57， P<0.001)。EV-A71所致手足口病集中在4~7月份，占总病例的73.97%(287/388)。EV-A71 VP1区同源性分析显示，分离到的20株EV-A71毒株均属于C4a亚型，核苷酸与氨基酸同源性分别为94.4%~96.1%、99.4%~100%，与以往西安市分离到的EV-A71同源性在91.5%以上。EV-A71 VP1区遗传进化分析结果显示，西安市2008—2018年EV-A71毒株与C4a亚型代表株处于同一分支，形成多个流行簇，且随着时间推移VP1区变异程度增大。 结论:其他肠道病毒为2017—2018年西安市手足口病主要病原，C4a亚型EV-A71仍在西安市持续流行，应加强对于HFMD病原谱及分子流行病学的监测，为进一步有效防治HFMD提供工作依据。