红条毛肤石鳖和日本花棘石鳖的转录组比较分析
Journal of Minjiang University（2021）
Abstract
多板纲动物具有独特的形态结构,而且在软体动物的系统进化中占有重要地位,但目前有关多板纲的分子生物学研究十分欠缺.该研究通过RNA-seq技术对红条毛肤石鳖和日本花棘石鳖进行了转录组测序,组装后分别获得121892和83776个Unigene,虽然两个物种属于不同的科,但GO和KEGG功能富集分析结果显示二者表达基因较为一致,SSR在转录本中的数量与分布也无显著差异.此外,鉴于Pax基因与动物形态结构发育密切相关,且在多板纲中的研究几乎为空白,所以该研究着重关注了Pax基因.通过转录组数据分析,共筛选到8条Pax基因,在系统进化树中均与相对应的软体动物Pax基因亚族聚为一支,表明多板纲的Pax基因进化保守.该研究获得的转录组信息丰富了多板纲的分子数据,为进一步探究多板纲动物生物学性状提供了良好的遗传信息基础.
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