养殖塘和市售小龙虾肠道细菌多样性的比较

养殖塘与市售小龙虾在摄食、存活率方面存在明显差异.为了揭示这些差异是否与肠道细菌群落组成有关,通过Illumina高通量测序技术研究了养殖塘和市售小龙虾肠道细菌群落组成,并对群落功能进行了分析.结果显示,养殖塘小龙虾肠道细菌群落组成与市售小龙虾差异明显.养殖塘小龙虾肠道细菌优势门为变形菌门(Proteobacteria)(占49.98％ ～58.11％)、厚壁菌门(Firmcutes)(9.51％ ～36.76％)、软壁菌门(Teneri-cutes)(6.02％ ～26.96％)和拟杆菌门(Bacteroidetes)(4.06％ ～4.14％);市售小龙虾肠道细菌主要优势门为拟杆菌门(21.05％ ～39.22％)、厚壁菌门(20.51％ ～35.94％)、暂定门RsaHF231(11.55％ ～46.34％)和变形菌门(4.29％ ～11.04％).在属水平上,柠檬酸杆菌属和哈夫尼菌属是养殖塘小龙虾肠道中的正常核心菌群,但其在市售样本中占比较低;暂定门RsaHF231未分类属、拟杆菌属、丹毒丝菌科的[Anaerorhabdus]_furcosa_group和g_ZOR0006是市售小龙虾肠道中的优势类群,但在养殖塘样本中含量较低.COG功能预测结果显示,养殖塘小龙虾肠道细菌群落的代谢功能较市场样本旺盛.与养殖塘小龙虾相比,市售小龙虾肠道细菌群落组成和功能有较大差异,这可能与其摄食减少、存活率降低有关.