2016-2017年河北正定县、湖南湘潭县及浙江玉环市轮状病毒VP7基因的分子流行病学特征

目的 分析2016-2017年河北正定县、湖南湘潭县及浙江玉环市轮状病毒(rotavirus,RV) VP7基因的分子流行病学特征.方法 收集2016-2017年上述3个地区RV感染者粪便样本,采用RT-PCR法扩增RV阳性样本的VP7基因片段,并进行测序分型.同时对VP7基因核苷酸序列进行同源性分析,并构建进化树;将核苷酸序列翻译为氨基酸序列,分析原型株及UK-人重配疫苗毒株与3个地区样本VP7氨基酸序列的差异.结果 测序结果共有G1、G2、G3、G94种基因型,所占比例分别为5.1％ (10/199)、21.6％(43/199)、6.0％ (12/199)、67.3％ (134/199);4种G基因型RV与相应原型株进化距离较远,核苷酸序列相似性分别为90.6％ ～ 91.9％、83.5％ ～ 94.0％、82.6％～97.2％、75.8％～89.8％;与原型株及UK-人重配疫苗毒株比较,4种G基因型RV可变区分别有15、12、17、32个氨基酸位点存在差异.结论 同一时间不同地区RV的G基因型优势流行株不同,流行株G9的优势亚型也会随时间发生变化,应加强对病毒的流行病学监测.