牛ZC3H12C基因在组织和胎盘中的等位基因表达及DNA甲基化状态分析

张萃, 杨欣怡,刘晓倩, 赵广武,谷书凯,李世杰, 孟世雄,杨子怡

Journal of Agricultural Biotechnology(2021)

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摘要
基因组印记(genomic imprinting)作为表观遗传现象,是指依赖亲本来源特异性的单等位基因表达.印记基因在哺乳动物胚胎和胎盘发育以及个体生长中具有重要作用.ZC3H12C(zinc finger CCCH-type containing 12C)基因编码具有CCCH-type锌指结构的转录因子,参与调控人类(Homo sapiens)多种免疫性疾病.ZC3H12C首先在人类胎盘中被发现为印记基因,在牛(Bos taurus)中是否发生印记尚不明确.本研究首先分析牛ZC3H12C基因结构,进而基于SNP比较基因组DNA和cDNA扩增产物的方法分析牛ZC3H12C基因在组织和胎盘中的等位基因表达状态,发现ZC3H12C基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、大脑等6个组织均表现为单等位基因表达,在胎盘中表现为双等位基因表达.进一步利用亚硫酸盐测序法分析ZC3H12C基因的甲基化状态,发现在单等位基因表达的肝脏和肾脏中,X2剪接体的第1个内含子上含有一段差异甲基化区,而在双等位基因表达的胎盘中,该区域呈现轻甲基化.上述结果提示,DNA甲基化可能参与调控牛ZC3H12C基因的单等位基因表达.本研究结果可为深入研究牛ZC3H12C基因的功能提供参考依据.
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