三穗鸭SCNN1B基因组织表达及其SNPs与蛋壳品质的相关性分析

钠离子无电位门控通道1β(sodium channel nonvoltage-gated 1β,SCNN1B)在阳离子转运中具有重要作用,可转运Na+并促进Ca2+分泌,从而影响蛋壳品质.本研究以蛋鸭品种三穗鸭(Anas platyrhyncha domestica)为研究对象,利用qRT-PCR检测SCNN1B基因的组织表达,以直接测序法检测SCNN1B基因遗传变异,利用SPSS 18.0的单因素方差分析方法评价其变异对蛋壳品质的影响.结果显示,SCNN1B基因在三穗鸭12个组织均有不同程度表达,表达量丰度依次为子宫>肾>腿肌>十二指肠>腺胃>胸肌>肝>肺>脑>心>脾>肌胃,在子宫中的表达丰度显著高于其他组织(P<0.05);在SCNN1B基因中检测到3个中度多态位点,其中g.794619 C>T和g.794635 G>T位于第8内含子,g.794564 G>A是位于第8外显子的同义突变位点,该外显子突变导致mRNA二级结构发生改变;g.794635 G>T和g.794564 G>A基因型分布极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01);3个SNP位点之间都存在强连锁不平衡,且产生4种单倍型和5种双倍型;g.794619 C>T位点TC基因型个体在蛋壳重上显著高于TT基因型(P<0.05),双倍型H1H3和H1H4个体在蛋壳重上显著高于H1H1(P<0.05).上述研究结果提示,SCNN1B基因在三穗鸭中具有组织表达特异性,g.794619 C>T位点的TC基因型有利于提高蛋壳重,双倍型H1H3是提高蛋壳重的有利双倍型.本研究为蛋鸭蛋壳品质的改善及遗传标记的选择提供参考依据.