基于microRNAs组学的丹参酮ⅡA对心肌缺血损伤大鼠骨髓间充质干细胞影响

目的 应用miRNA表达芯片筛选丹参酮ⅡA干预骨髓间充质干细胞分化过程中差异表达的miRNA,并对其进行生物信息学分析,揭示心肌缺血的机制.方法 制备心肌缺血损伤大鼠模型并提取骨髓间充质干细胞进行培养,使用丹参酮ⅡA含药血清干预,以生理盐水做阴性对照,两组均置培养箱中孵育24h后去掉两组的培养液,以DMEM培养基进行连续2次洗涤及培养,换液后诱导分化7d、14 d、28 d,然后运用TRIzol法提取大鼠BMSCs中总RNA,使用GenePix Pro 6.0表达谱芯片检测细胞miRNA的表达,接着对预测靶基因进行GO分析、KEGG通路分析、VISANT、STRING数据库分析蛋白相互作用.结果 (1)层次聚类分析提示有17个miRNA差异表达,其中8个上调、9个下调.(2)运用8个基因预测数据库交集分析确定靶基因49个,GO分析发现这些靶基因主要参与27种生物学过程、1种细胞组分、8类分子途径;KEGG通路发现有5条信号转导通路.(3)运用VISANT检索与靶基因相互作用的蛋白产物,发现节点(Nodes)86个,路径映射(Pathway Mapped) 17个,节点的功能种类包括28类;STRING软件总共筛选出14个靶基因的蛋白产物存在相互作用,构建靶基因互作网络图.结论 (1)丹参酮ⅡA可干预心肌缺血损伤大鼠骨髓间充质干细胞miRNA的表达.(2)通过预测miRNA的差异miRNAs可知,经转录后的miRNAs表达主要由信号传导通路、miRNA转录与调控发挥作用.(3)生物信息学GO富集及KEGG通路后提示miRNAs与心肌的分化、再生有关系,挖掘的靶基因CXCR4、Bcl-XL、VEGFa及Rap1信号通路、Ras信号通路均能影响心肌缺血.