基于COⅠ基因对东北林蛙、中国林蛙等蛙属24种的鉴定

目的:利用DNA条形码线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因(COⅠ)技术对东北林蛙等24种进行鉴别,构建邻接(NJ)系统发育树,对24种进行系统聚类分析,为东北林蛙等蛙类的鉴别,分类及新种的发现提供一定的依据.方法:收集东北林蛙、中国林蛙、黑龙江林蛙、徂崃林蛙、桓仁林蛙各10只,提取其DNA并进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,将扩增成功的序列测序,共测得50条CO Ⅰ基因序列;从GenBank数据库中获得蛙科蛙属24种163条CO Ⅰ基因序列及蛙科侧褶蛙属,臭蛙属,琴蛙属,水蛙属,湍蛙属各一条CO Ⅰ基因序列;利用MEGAX进行序列比对,分析各物种CO Ⅰ基因序列简约性信息位点,计算种内,种间遗传距离,构建NJ树进行系统聚类分析.结果:东北林蛙等24种CO1基因序列长度为554 bp,共有210个简约性信息位点,各物种种内遗传距离均＜2％;除桑植蛙与明全蛙种间遗传距离为0.004外,其余各物种种间遗传距离范围为0.024～0.228;桑植蛙与明全蛙聚为一支,部分东北林蛙与Rana utenoi聚为一支,中国林蛙有2个独立的分支,其余各物种均独立聚为一支.结论:DNA条形码CO Ⅰ技术能够对东北林蛙等21种进行鉴定及鉴别,支持桑植蛙与明全蛙,韩国林蛙与昆嵛林蛙为同物异名,其中一支中国林蛙可能是蛙科蛙属未下载的4个种之一或新种.这表明DNA条形码CO Ⅰ技术不仅可以鉴定及鉴别东北林蛙等24种蛙类,也可以为蛙科蛙属的分类,新种或亚种的发现提供一定的科学依据.