基于网络药理学与分子对接探究鬼箭羽治疗糖尿病肾病的作用机制
Journal of Traditional Chinese Medicine University of Hunan(2021)
摘要
目的 采用网络药理学方法及分子对接技术探讨鬼箭羽治疗糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)的作用机制.方法 通过文献查找、TCMSP数据库、BATMAN-TCM数据库及TCM@TAIWAN中医数据库筛选鬼箭羽主要成分及作用靶点,在Drugbank、TTD、OMIM、GeneCards数据库获取DKD相关靶点,利用Cytoscape软件分别构建"中药-成分-靶点""中药-成分-靶点-疾病"相互作用网络;运用STRING数据库构建蛋白互作网络,并根据拓扑学参数筛选鬼箭羽治疗DKD的关键靶点;对关键靶点进行GO功能富集和KEGG通路分析,并构建"成分-靶点-通路"网络图,运用AutoDock Tools和Pymol将得到的主要活性成分与关键靶点进行分子对接.结果 共获得鬼箭羽有效成分14个,作用于564个潜在靶点,DKD靶点1106个,拓扑分析得到关键靶点41个,其中度值大于50的靶点有23个,包括IL-6、TNF、AKT1、VEGFA等.GO功能富集分析得到生物过程主要涉及氧化物的反应、活性氧的调控、细胞凋亡的调控等;KEGG通路富集分析主要包括AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化、TNF信号通路等.分子对接结果显示,槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素与4个核心靶点均具有较好的结合活性.结论 鬼箭羽可能通过槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素等多种活性成分作用于多个靶点,参与调节多条信号通路,发挥抗炎、抗氧化应激、抗缺氧、抑制细胞凋亡以及改善肾血流动力学等作用,从而保护肾功能,延缓糖尿病肾病的进展.
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