5例HIV-1感染者pol基因进化和感染时间推断研究

目的 研究未接受抗反转录病毒治疗的HIV-1感染者pol基因进化特征,并用贝叶斯合并理论推断感染时间,为艾滋病疫情评估提供依据.方法 募集5例未接受抗反转录病毒治疗的HIV-1感染者,定期随访并采集血样,用RT-PCR法扩增pol基因片段,分析基因型耐药突变;采用贝叶斯合并理论分析毒株进化关系,构建最大可信(MCC)进化树,推测其最近共同祖先株形成时间,进而推断感染时间.结果 5例HIV-1感染者均为男性,年龄为27～50岁.每例感染者有5～9个采样时间点,其pol基因序列各自聚集成一个独立的次级进化簇(后验概率值为100％).1例急性期感染者携带传播性耐药突变(M46I突变),并表现出快速疾病进展和准种病毒变异特征.推断3例急性期感染者的感染时间为HIV抗体初筛有反应前1～5个月;2例初检即确证病例感染时间分别为HIV抗体初筛有反应前14个月和前7个月.结论 运用贝叶斯合并理论分析HIV-1感染者pol基因进化情况,可大致推断感染时间,有助于艾滋病疫情形势研判.