一起输入型食源性疾病病原的实验室快速检测及分子溯源分析

目的 通过对一起输入型食源性疾病的病原学鉴定和分子溯源分析,为科学指导临床诊断治疗及流行病学调查工作提供参考.方法 收集20例腹泻病患者粪便标本,分别采用Filmarray快速鉴定和分离培养的方法,对分离到的菌株进行血清分型、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型、全基因组测序(WGS),通过基因序列比对对病原菌的毒力岛、毒力基因、耐药基因和质粒携带情况进行分析,通过多位点序列分型(MLST)和单核苷酸多态性(SNP)对菌株进行溯源.结果 从2位患者粪便标本中分离培养得到的肠炎沙门菌PFGE型别一致,与本地沙门氏菌PFGE图谱有显著区别,分离株的毒力岛、毒力基因、耐药基因携带情况各不同,但都拥有一处非同义突变(gyrA基因),可能影响萘啶酮酸、环丙沙星的耐药性,MLST均为ST11型,SNP聚类结果显示与泰国临床分离株较为接近.结论 加强入境旅客的健康监测,进一步做好输入性传染病防控工作,建立健全输入型疾病预警机制,尤其注意防范耐药菌输入风险的发生.