胃癌相关幽门螺杆菌毒力和粘附基因进化分析
Journal of Parasitic Biology(2021)
Abstract
目的 分析幽门螺杆菌(Hp)细胞毒素相关基因羧基末端(cagA 3')可变区和血型抗原结合粘附基因(babA)序列变异及进化特征,探寻致癌相关Hp亚群. 方法 对150株Hp菌株采用聚合酶链反应(PCR)方法扩增cagA、vacA和babA基因并进行毒力基因分型,比较毒力基因型在胃炎(91株)组和胃癌组(59株)中的分布差异;分别对Hp cagA 3可变区和babA PCR产物进行一代测序并构建系统进化树. 结果 在150株Hp菌株中,胃癌组cagA+基因型为100.00%,胃炎组为93.41%,且大部分(92.14%)为携带东亚型CagA EPIYA-ABD基序的菌株;胃癌组中vacA s1/m1、vacA s1/m2和babA+基因型Hp菌株分别占44.07%、55.93%和98.31%,胃炎组分别占48.35%、50.55%和98.90%,差异无统计学意义(P均>0.05).基于Hp cagA 3'可变区及babA基因序列构建Neighbour-Joining系统进化树,在cagA 3'Cluster Ⅰ亚群和babA Cluster Ⅰ亚群中胃癌组Hp菌株,分别占84.48%和80.36%,胃炎组分别为29.27%和39.47%,差异均有统计学意义(P均<0.05). 结论 胃癌相关Hp菌株分别在cagA 3'可变区和babA序列构建的系统进化树上明显聚集成亚群,具有更相似的遗传进化特征.
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