中国西北部地区多房棘球绦虫cox1基因多态性研究

目的 分析四川省西部多房棘球绦虫遗传多态性,对我国西北部地区多房棘球绦虫不同地理亚群的亲缘关系和基因多样性进行探索. 方法 采用线粒体cox1基因完整序列对四川省西部藏区64份来源于不同生物宿主的多房棘球绦虫样本进行遗传多态性分析,同时收集GenBank数据库中来源于中国不同地区的多房棘球绦虫的cox1基因序列,比对分析不同地理来源分离株的遗传多态性特征. 结果 (1)64份样本共检出5个单倍型,均属于多房棘球绦虫亚洲亚群.单倍型多样性与低核苷酸多样性分别为0.179±0.064和0.00013±0.00005.(2)搜索GenBank数据库,结合本研究中序列信息,共获得181条来源于四川、青海、新疆和内蒙古的多房棘球绦虫cox1基因序列,获得45个单倍型.单倍型网络图呈现星状排列,中央单倍型为四川、青海和新疆三地共有,其余单倍型为各地独有.构建的ML系统发育树分支与单倍型地理分布相对应,形成较为明显的地理结构. 结论 四川省西部地区多房棘球绦虫遗传多样性较低,寄生于不同宿主的多房棘球绦虫间无明显遗传差异.我国不同地区多房棘球绦虫遗传变异特征的分析确证需要进一步的数据支撑.